A primeira versão do ImazonGeo foi lançada em 5 de junho de 2007, com o apoio da Fundação Moore, da Agência dos Estados Unidos para o Desenvolvimento Internacional (USAID) e da Fundação Packard. Em 2009, uma nova versão, chamada ImazonGeo 2.0, foi lançada, recebendo apoio adicional da Fundação Moore, da Fundação Avina e do Fundo Vale. Em 2018, devido ao avanço das tecnologias de publicação de mapas na web, foi introduzida a versão ImazonGeo 3.0, que visava aprimorar a disseminação do conteúdo do portal para um público diversificado, incluindo municípios, ONGs, Ministério Público, agências estaduais e federais de regularização fundiária e mídias sociais. Essa atualização facilitou o acesso a informações sobre a influência da ocupação humana na Floresta Amazônica, contribuindo para o aumento da transparência no setor florestal e para a conservação da paisagem florestal. Lançado no estande “Espaço Amazônia: Floresta e Comunidade”, durante o IX CBUC – Congresso Brasileiro de Unidades de Conservação.
Atualmente, o ImazonGeo evoluiu para um portal que, além de oferecer um mapa navegável, apresenta uma página dedicada às iniciativas de monitoramento na Amazônia. Esta nova versão recebeu apoio da Skoll Foundation e contém informações sobre desmatamento, degradação florestal, exploração madeireira, abertura de estradas não autorizadas, superfície de água, uso e cobertura da terra, além de ameaças e pressões sobre áreas protegidas e previsões de risco de desmatamento.
